Pelajari Dasar-Dasar Bagaimana DNA Dapat Diekstraksi Dari Sel

Table of Contents

 

(Source: Joo Nath [CC BY-SA 4.0] via Wikimedia Commons).

INFOLABMED.COM - Seberapa penasaran Anda dengan Analisis DNA? nyatanya analisis DNA ini dapat digunakan untuk berbagai hal.

Diantaranya, Analisis DNA dapat digunakan dalam mencocokkan sampel TKP, menguji penyakit genetik, dan juga untuk mengidentifikasi spesies baru. 

Tidak mudah dalam menganalisis DNA, ada beberapa langkah pertama  yang harus di lakukan dalam analisis DNA, yang pertama adalah ekstraksi DNA dari sampel yang akan kita analisis atau periksa. 

Proses penentuan Sampel DNA dari manusia dan banyak hewan atau juga lainnya, sering kali diambil dari darah atau sel kulit. 

Cara termudah untuk mengumpulkan sel kulit manusia adalah dengan menyikat bagian dalam pipi dengan kapas. Ini disebut usap bukal . “Buccal” adalah istilah yang berarti pipi atau mulut. 

Sampel DNA dari hewan kecil (seperti serangga) atau tumbuhan dapat diekstraksi dari sampel jaringan kecil. 

Proses Analisis DNA membutuhkan DNA murni. DNA sendiri berada di dalam sel. Tapi ada banyak bahan lain di dalam sel juga.

 Misalnya, sel juga mengandung membran dan protein. Untuk mendapatkan DNA murni, teknisi harus memisahkan dan menghilangkan bahan-bahan yang tidak diinginkan terlebih dahulu. 

Oleh karena itu, berikut lngkah-langkah dasar dalam mengekstraksi DNA. Langkah ini sama dalam proses ekstraksi DNA, apa pun jenis selnya.

Lisis sel

Kata lisis berarti “memisahkan.” Di dalam sel, lisis terjadi ketika membran pecah. Sel mempunyai membran luar yang disebut membran sel . 

Mereka juga memiliki membran bagian dalam yang mengelilingi DNA. Membran bagian dalam ini disebut membran inti . Membran sel terdiri dari dua lapisan lipid (molekul lemak) dan protein . 

Lisis kimia merupakan salah satu cara untuk memecah membran sel dan membran inti. Dalam lisis kimia, teknisi laboratorium menambahkan   deterjen ke dalam sel. 

 Deterjen memisahkan molekul lipid, menyebabkan kerusakan membran. (Deterjen membersihkan piring dengan cara yang sama. 

Deterjen mengikat lemak (lipid), sehingga partikel lemak lebih mudah dibersihkan dengan air.) 

Lisis fisik juga dapat membantu memecah membran sel. Ini melibatkan penggilingan atau pencampuran sel, yang merusak membrannya. Lisis kimia terkadang dikombinasikan dengan lisis fisik.

 Pengendapan DNA

Setelah sel dan membran inti dipecah, molekul lipid harus dihilangkan. Seorang teknisi laboratorium menambahkan larutan garam yang sangat pekat. 

Hal ini menyebabkan deterjen dan sisa-sisa sel lainnya, seperti protein, mengendap . Mengendap berarti membentuk padatan yang terpisah dari larutan.

DNA tetap terlarut dalam larutan cair. Hal ini dapat dihilangkan dari puing-puing sel dengan sentrifugasi 

. Dalam sentrifugasi, larutan cair berputar dengan kecepatan tinggi sehingga endapan terkumpul sebagai pelet di dasar tabung. 

DNA yang masih terlarut dalam cairan dapat dipindahkan ke tabung sampel baru. Alternatifnya, endapan dapat disaring dari larutan. Dengan begitu, cairan yang mengandung DNA akan tertinggal.

DNA dalam nukleus dibungkus di sekitar protein yang disebut histon . Ini membantu mengatur DNA menjadi kromosom . 

Untuk menghilangkan protein histon, protease dapat ditambahkan. Protease adalah enzim yang memecah protein. 

Penghapusan DNA

DNA sekarang perlu dikeluarkan dari larutan cair. DNA larut dalam air. Artinya bisa larut dalam air. Namun, ia tidak larut jika terdapat alkohol dan garam.

 Teknisi laboratorium dapat menambahkan etanol atau isopropil alkohol (alkohol gosok) sehingga DNA menggumpal dan membentuk endapan putih yang terlihat. 

Penting untuk menggunakan alkohol dingin karena memungkinkan lebih banyak DNA yang dapat diekstraksi.

 Jika alkohol terlalu hangat, hal ini dapat menyebabkan DNA mengalami denaturasi [tebal], atau rusak. 

Selama sentrifugasi, DNA mengembun menjadi pelet. Ketika alkohol dihilangkan, DNA yang relatif murni akan tertinggal!

Referensi : 

• https://letstalkscience.ca/