Mengenal Lebih Dekat Genome of Human Metapneumovirus (HMPV): Struktur, Fungsi, dan Variasi Genetik

Table of Contents

INFOLABMED.COM - Human Metapneumovirus (HMPV) adalah salah satu virus pernapasan penting yang memiliki genom berbentuk RNA untai tunggal negatif (-ssRNA). 

Genom ini terdiri dari delapan gen yang menyandi sembilan protein vital untuk fungsi virus. 

Genom HMPV berukuran sekitar 13,2 Kb dengan urutan gen dari ujung 3′ ke 5′ adalah N–P–M–F–M2–SH–G–L.

Struktur dan Fungsi Protein HMPV:

1. Nucleoprotein (N protein): Membantu pembentukan nukleokapsid.
2. Phosphoprotein (P protein): Berperan dalam replikasi dan transkripsi virus.
3. Matrix protein (M protein): Membantu dalam perakitan dan pemekaran virus.
4. Fusion glycoprotein (F protein): Membantu fusi virus ke dalam sel inang.
5. Putative transcription factor (M2-1 protein): Mengatur transkripsi.
6. RNA synthesis regulatory factor (M2-2 protein): Mengatur sintesis RNA.
7. Small hydrophobic glycoprotein (SH protein): Fungsinya belum jelas, kemungkinan dalam interaksi virus-inang.
8. Attachment glycoprotein (G protein): Membantu dalam pelekatan virus ke sel inang.
9. Viral polymerase (L protein): Berperan dalam replikasi dan transkripsi virus.

Variasi Genetik HMPV:

Analisis genom keseluruhan menunjukkan bahwa HMPV memiliki dua genotipe utama, yaitu A dan B, yang kemudian dibagi lagi menjadi subgrup A1, A2, B1, dan B2 berdasarkan variasi pada glikoprotein permukaan G dan F. 

Subgrup A2 lebih lanjut dibagi menjadi A2a dan A2b. Penelitian terbaru melaporkan varian unik HMPV dengan duplikasi 180 nt dan 111 nt pada gen G, yang menambah kompleksitas variasi genetik virus ini.***